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NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2

NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2

货号：
#1002421
#1002422
NadPrep® DNA Library Preparation Kit v2 是基于 A-T 连接原理，针对 MGI & Illumina 高通量测序平台开发的双链 DNA 文库构建试剂盒。该试剂盒适用于 1‒500 ng DNA 的全基因组测序，同时兼容液相杂交靶向捕获测序。在 v1 版本的基础上，升级后的试剂盒提高了文库转化效率，同时对低质量的样本包容度更好，因此能在维持高保真度的同时，提升文库的丰富度。
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产品特色

● 快速便捷
 3 hr 内完成全基因组文库制备全流程
● 稳定高效

更高的文库产出
更高的文库转化率

低 GC 偏好性

更高的文库丰富度
● 灵活兼容
自由选择搭配多类型接头
兼容 1 ng-500 ng 起始投入量
兼容 gDNA、FFPE DNA、cfDNA 等样本类型

兼容液相杂交捕获

建库流程

1-流程图

产品表现

文库产出稳定高效

兼容宽泛的投入量

图1

图 1. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 对不同起始量 gDNA 样本的建库产出。利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行文库构建。A. 文库产出(MGI)；B. 文库产出 (Illumina)。

注：样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1521)。

兼容不同类型样本

图2

图 2. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 对不同类型样本的建库产出。不同类型样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 A. NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 B. NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) 进行文库构建，扩增循环数参考相应说明书。
注：样本分级标准 | gDNA：~ 15 kb 有明亮单一不拖尾条带；FFPE C：条带主要分布在 200-2500 bp，呈弥散状。

兼容不同类型接头

图3


图 3. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 显著提升文库产出。不同投入量样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Kit/Module (for Illumina®/MGI) (NadPrep® v1) 和 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 (NadPrep® v2) 分别搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module [Universal Stubby (UDI)]、NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) [MDI]、NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) [UMI] 和 NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module (for MGI) [BMI] 进行文库构建。

注：gDNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1471)。

低 GC 偏好性

图4

图 4. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 对宏基因组样本的建库表现。A. 金黄色葡萄球菌，B. 大肠埃希菌和 C. 铜绿假单胞菌等不同 GC 含量的全基因组文库的 GC 偏好性。

更高的文库转化率

图5


图 5. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 具有更高的文库转化率。10 ng 血浆 cfDNA 样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 分别搭配 NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) 进行预文库构建，以 2 Kb Panel 搭配 μCaler 杂交捕获系统完成杂交捕获。测序模式分别为 DNBSEQ-T7，PE 150 和 Illumina Novaseq 6000，PE 150。每个样本随机选取 1.0 Gb 用于数据分析，以双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences, DCS211) 为标准进行过滤。

注：相对文库转化率：NadPrep® v2 及竞品建库试剂盒文库转化率与 NadPrep® DNA Library Preparation Kit/Module (for Illumina®/MGI) (NadPrep® v1) 文库转化率的比值 ( NadPrep® v1 文库转化率统一归一化为 1 )。

更高的文库丰富度

图6


图 6. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 具有更高的文库丰富度。10 ng 血浆 cfDNA 样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 搭配 NadPrep® UMI Adapter Kit (with 10 nt Index) 进行预文库构建，以 2 Kb Panel 搭配 μCaler 杂交捕获系统完成杂交捕获。测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE 150。每个样本随机选取 1.0 Gb 用于数据分析，以双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences，DCS211) 、单链一致性序列 (SSCS) 为标准进行过滤。

兼容液相杂交捕获

图7

图 7. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 构建文库的捕获表现。50 ng FFPE C 级 DNA 样本利用 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2 构建预文库，500 ng/预文库投入，分别以 LungCancer Panel v1.0 (0.23 Mb) 和 NanOnco Plus Panel v3.0 (2.4 Mb) 搭配 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150。A. 捕获数据的比对率和中靶率；B. 靶区域覆盖度；C. Fold 80 base penalty； D. 靶区域去重后的平均深度。

标准品变异分析

图8

图 8. NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 构建文库的捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性展示。利用 NadPrep® DNA 文库构建试剂盒 v2 搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 构建文库，扩增 6 个循环，以 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 搭配 LungCancer Panel v1.0 (0.23 Mb) 完成杂交捕获，杂交 16 hr。

注：样本为肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM001)，起始投入量为 50 ng。

建库模块

包装编号 管盖颜色 组分名称 包装体积
1002421(24 rxn) 		包装体积
1002422 (96 rxn)
Box1

EndRepair & A-Tailing Buffer Pro 180 µL 690 µL

End Repair & A-Tailing Enzyme Pro 120 µL 460 µL

Ligation Buffer 750 µL 2×1500 µL

DNA Ligase  65 µL 250 µL

2X HiFi PCR Master Pro Mix 720 µL 2×1600 µL

/

Nuclease Free Water 2.5 mL 8 mL

TE Solution 1 mL 4 mL
Box2

/

NadPrep SP Beads 4 mL 15 mL

单端接头模块 (for MGI)

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003611 (24 rxn) 		包装体积
1003621 (96 rxn) 		包装体积
1003622(96 rxn)

NadPrep M-Index (SI) Primer Mix  # 12×15 µL (Tube) 24×25 µL (Tube) 24×25 µL (Tube)

NadPrep M-Adapter (SI) 60 µL (Tube) 230 µL (Tube) 230 µL (Tube)
管盖颜色 组分名称

包装体积

1003641 (96 rxn)

NadPrep M-Index (SI) Primer Mix  # 96×8 µL (Plate)

NadPrep M-Adapter (SI) 260 µL (Tube)

NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, SI) 75 µL (Tube)

双端唯一接头模块 (for MGI)

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003711 (24 rxn) 		包装体积
1003721 (96 rxn) 		包装体积
1003722 (96 rxn) 		包装体积
1003725 (96 rxn) 		包装体积
1003726 (96 rxn)

NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix  # 12×15 µL (Tube) 24×25 µL (Tube) 24×25 µL (Tube) 24×25 µL (Tube) 24×25 µL (Tube)

NadPrep M-Adapter (DI) 60 µL (Tube) 230 µL (Tube) 230 µL (Tube) 230 µL (Tube) 230 µL (Tube)
管盖颜色 组分名称

包装体积

1003751 (96 rxn)

包装体积

1003752 (96 rxn)

包装体积

1003753 (96 rxn)

包装体积

1003754 (96 rxn)

NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix  # 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate)

NadPrep M-Adapter (DI) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube)

NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) 75 µL (Tube)  75 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube)

管盖颜色 组分名称

包装体积

1003761 (1152 rxn)

包装体积

1003762 (1152 rxn)

包装体积

1003763 (1152 rxn)

包装体积

1003764 (1152 rxn)

NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix  # 96×72 µL (Tube) 96×72 µL (Tube) 96×72 µL (Tube) 96×72 µL (Tube)

NadPrep M-Adapter (DI) 2×1350 µL (Tube) 2×1350 µL (Tube) 2×1350 µL (Tube) 2×1350 µL (Tube)

NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) 900 µL (Tube) 900 µL (Tube) 900 µL (Tube) 900 µL (Tube)

通用截短型双端唯一接头模块（for Illumina）

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003240 (24 rxn) 		包装体积
1003241 (96 rxn) 		包装体积
1003242 (96 rxn)

NadPrep Universal UDI-index Primer Mix  # 12×15 µL (Tube) 24×25 µL (Tube) 24×25 µL (Tube)

NadPrep Universal Stubby Adapter 60 µL (Tube) 230 µL (Tube) 230 µL (Tube)

NadPrep Amplification Primer Mix II 20 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube)
管盖颜色 组分名称

包装体积
1003251 (96 rxn)

包装体积
1003252 (96 rxn)

包装体积
1003253 (96 rxn)

包装体积
1003254 (96 rxn)

包装体积
1003255 (96 rxn)

包装体积
1003256 (96 rxn)

包装体积
1003257 (96 rxn)

包装体积
1003258 (96 rxn)

NadPrep Universal UDI-index Primer Mix  # 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate) 96×8 µL (Plate)

NadPrep Universal Stubby Adapter 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube) 260 µL (Tube)

NadPrep Amplification Primer Mix II 75 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube) 75 µL (Tube)

管盖颜色 组分名称

包装体积

1003261 (1152 rxn)

包装体积

1003262 (1152 rxn)

包装体积

1003263 (1152 rxn)

包装体积

1003264 (1152 rxn)

NadPrep Universal UDI-index Primer Mix  # 96×72 µL (Tube) 96×72 µL (Tube) 96×72 µL (Tube) 96×72 µL (Tube)

NadPrep Universal Stubby Adapter 2×1350 µL (Tube) 2×1350 µL (Tube) 2×1350 µL (Tube) 2×1350 µL (Tube)

NadPrep Amplification Primer Mix II 900 µL (Tube) 900 µL (Tube) 900 µL (Tube) 900 µL (Tube)

全长型双端唯一接头模块（for Illumina）

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003211 (24 rxn) 		包装体积
1003212 (24 rxn) 		包装体积
1003211 (96 rxn) 		包装体积
1003212 (96 rxn) 		包装体积
1003213 (192 rxn) 		包装体积
1003224* (480 rxn)

NadPrep UDI Adapter # 12×10 µL (Tube) 12×10 µL (Tube) 12×22 µL (Tube) 12×22 µL (Tube) 24×22 µL (Tube) 96×3.5 µL (Plate)×5
*包装形式为 96 rxn/Plate。


分子标签接头模块 (for MGI, SI)

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003811 (24 rxn) 		包装体积
1003821 (96 rxn) 		包装体积
1003822(96 rxn)

NadPrep M-Index (SI) Primer Mix  # 12×15 µL 24×25 µL 24×25 µL

NadPrep BMI-Adapter 60 µL 230 µL 230 µL
包装编号 管盖颜色 组分名称 包装体积
1003820 (480 rxn)
Box1

NadPrep M-Index (SI) Primer Mix  # 96×30 µL
Box2

NadPrep BMI-Adapter 1100 µL

分子标签接头模块  (for MGI, DI)

管盖颜色 组分名称 包装体积
1003911 (24 rxn) 		包装体积
1003921 (96 rxn) 		包装体积
1003922(96 rxn) 		包装体积
1003925 (96 rxn) 		包装体积
1003926 (96 rxn)

NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix  # 12×15 µL 24×25 µL 24×25 µL 24×25 µL 24×25 µL

NadPrep BMI-Adapter 60 µL 230 µL 230 µL 230 µL 230 µL

分子标签接头模块（for Illumina）

管盖颜色 组分名称 包装体积
1103111 (24 rxn) 		包装体积
1103121 (96 rxn) 		包装体积
1103122 (96 rxn)

NadPrep Universal UDI-Index Primer Mix # 12×15 µL 24×25 µL 24×25 µL

NadPrep UMI Adapter 60 µL 230 µL 230 µL

NadPrep Amplification Primer Mix II 20 µL
 75 µL
 75 µL



NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？
完整标题：NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？

转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类，其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中，链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性，测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链；而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息，测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比，链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量，明确基因结构，同时识别反义转录本以及发现更多新转录本，因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言，文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素；若需获取转录本方向性信息，应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案，均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。

类别 产品 详情 货号
建库模块 NadPrep® DNA Library Preparation Module v2, 24 rxn 24 rxn 1002421
NadPrep® DNA Library Preparation Module v2, 96 rxn 96 rxn 1002422
单端接头模块 (for MGI) NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn SI 1-12 1003611
NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn SI 1-96 1003641
NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn SI 1-24 1003621
NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn SI 25-48 1003622
双端唯一接头模块 (for MGI) NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn MDI 1-12 1003711
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-24 1003721
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn MDI 25-48 1003722
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn MDI 49-72 1003725
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn MDI 73-96 1003726
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-96 1003751
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn MDI 97-192 1003752
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn MDI 193-288 1003753
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn MDI 289-384 1003754
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F1 (for MGI), 1152 rxn MDI 1-96 1003761
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F2 (for MGI), 1152 rxn MDI 97-192 1003762
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F3 (for MGI), 1152 rxn MDI 193-288 1003763
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F4 (for MGI), 1152 rxn MDI 289-384 1003764
通用截短型双端唯一接头模块 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn Index 1-12
24 rxn 		1003240
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn Index 1-24
96 rxn 		1003241
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn Index 25-48
96 rxn 		1003242
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn Index 1-96
96 rxn 		1003251
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn Index 97-192
96 rxn 		1003252
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn Index 193-288
96 rxn 		1003253
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn Index 289-384
96 rxn 		1003254
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E5, 96 rxn Index 385-480
96 rxn 		1003255
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E6, 96 rxn Index 481-576
96 rxn 		1003256
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E7, 96 rxn Index 577-672
96 rxn 		1003257
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E8, 96 rxn Index 673-768
96 rxn 		1003258
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn Index 1-96
1152 rxn 		1003261
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn Index 97-192
1152 rxn 		1003262
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn Index 193-288
1152 rxn 		1003263
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn Index 289-384
1152 rxn 		1003264
全长型双端唯一接头模块 (for Illumina®) NadPrep® UDI Adapter Kit, Set A (for Illumina®) Index 1-12
300 pmol / 接头 		1003211
NadPrep® UDI Adapter Kit, Set B (for Illumina®) Index 13-24
300 pmol / 接头 		1003212
NadPrep® UDI Adapter Kit, Set A&B (for Illumina®) Index 1-24
300 pmol / 接头 		1003213
NadPrep® UDI Adapter Kit Set C1 (for Illumina®) 24 rxn 1003221
NadPrep® UDI Adapter Kit Set D1 (for Illumina®) 480 rxn 1003224
分子标签接头模块 NadPrep® BMI Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn SI 1-12 1003811
NadPrep® BMI Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn SI 1-24 1003821
NadPrep® BMI Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn SI 25-48 1003822
NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn MDI 1-12 1003911
NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn MDI 1-24 1003921
NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn MDI 25-48 1003922
NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn MDI 49-72 1003925
NadPrep® BMI Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn MDI 73-96 1003926
NadPrep® UMI Adapter Kit Set A1 (with 10 nt Index), 24 rxn 1-12 1103111
NadPrep® UMI Adapter Kit Set B1 (with 10 nt Index), 96 rxn 1-24 1103121
NadPrep® UMI Adapter Kit Set B2 (with 10 nt Index), 96 rxn 25-48 1103122

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

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