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NadPrep®️ RNA & DNA 共建库模块
#1002412
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产品特色
● 灵活兼容
支持 10-100 ng RNA 和 1-100 ng DNA 不同比例的混合样本
兼容 MGI 和 Illumina 双测序平台
● 简单快速
一管式操作，快速便捷
RNA & DNA 单流程共建库，耗时 3-3.5 hr
● 高效均一
稳定高效的文库产出
均一的文库片段分布
低 GC 偏好性
● 背景菌控制
全流程全方位严控背景菌污染，包括环境控制、耗材控制、原料控制、工艺控制、生产过程控制、质量控制等
建库流程
产品表现
灵活兼容
图 1. NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module 对不同比例起始量 RNA & DNA 混合样本的文库产出。A. 文库产出；B. 文库产出 (UDI)。利用 NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module 分别搭配 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter(UDI) Module 进行文库构建。
注：RNA 样本为 K562 细胞系 RNA； DNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1521)。
图 2. NadPrep® RNA & DNA tNGS 全流程解决方案在双测序平台的检出情况。A. 捕获数据的比对率； B. Coronavirus (冠状病毒) reads 分布；C. Candida albicans (白色念珠菌) reads 分布；D. rRNA reads 分布。利用 NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module 进行预文库构建，以 NadPrep® ES Hybrid Capture Reagents 和 NEX-t Panel v1.0 完成杂交捕获，0.5 Gb 用于数据分析，经 DNBSEQ-T7, PE150 和 Illumina Novaseq 6000, PE150 测序。
注：横坐标标注表示拟宿主混合核酸样本起始投入量：掺入病原混合核酸样本起始投入量。拟宿主混合核酸样本为 Human Brain Total RNA 标准品 (Clontech, 636530) 和人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1521) 以 1:1 进行混合。掺入病原混合核酸样本为新型冠状病毒奥密克戎突变株基因组 RNA 标准物质 (中国计量科学研究院，NIM-RM 5225；1 pg 为 50 copies) 和 Candida albicans 标准品 (ATCC, 10231；1 pg 为 6000 copies) 以 1:1 进行混合。
有效提升检测灵敏度
图 3. 基于 NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module 分别采用 tNGS 和 mNGS 对模拟病原微生物样本的检出 reads 分布。 A. Coronavirus (冠状病毒) reads 分布； B. Candida albicans (白色念珠菌) reads 分布。
注：测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150。
图 4. 共建库与单建库对不同拷贝数的 RNA 混合样本的的捕获表现。A. 捕获数据 reads 分布；B. 富集倍数。
注：横坐标为新型冠状病毒奥密克戎突变株基因组 RNA 标准物质样本的拷贝数。样本来源于 Human Brain Total RNA 标准品 (Clontech, 636530) 和不同拷贝数的 RNA 病毒样本的混合物。
图 5. 共建库与单建库对不同微生物含量的模拟菌群样本的捕获后覆盖深度。模拟菌群样本分别使用 NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module (Co-Prep) 和 NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v2 (DNA-Prep) 搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Adapter 进行文库构建，以 NadPrep® ES Hybrid Capture Reagents 和 NEX-t Panel v1.0 完成杂交捕获。
注：样本来源为以人类基因组 DNA 标准品 (Promega，G1521) 按照不同比例对 20 菌株交错的混合基因组材料 (ATCC，MSA-1003) 进行稀释，以获得 0.001%-1% MSA-1003 的模拟菌群。测序模式为 Illumina Novaseq 6000， PE150。
低 GC 偏好性
图 6. NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module 对宏基因组样本的建库表现。A. 金黄色葡萄球菌，B. 枯草芽孢杆菌和 C. 发酵乳杆菌等不同 GC 含量的全基因组文库的 GC 偏好性。
临床真实样本应用示例
图 7. NadPrep® RNA & DNA tNGS 全流程解决方案对真实样本的检测表现。A. 文库产出；B. Rhinovirus A 和 Rhinovirus C reads 占比 。
注：样本来源为 50 ng 临床鼻病毒核酸样本。测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150。
文库构建模块
| 包装编号 | 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1002411(24 rxn) |
包装体积 1002412 (96 rxn) |
| Box1 |
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Co-Random Primer | 60 µL | 230 µL |
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1st Co-Strand Synth. Buffer | 120 µL | 460 µL | |
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1st Co-strand Synth.Enzyme | 60 µL | 230 µL | |
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2nd Co-strand Synth.Buffer | 230 µL | 920 µL | |
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2nd Co-strand Synth. Enzyme | 60 µL | 230 µL | |
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Co-FERA Buffer | 150 µL | 575 µL | |
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Co-FERA Enzyme |
150 μL |
575 μL |
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Ligation Buffer | 750 μL | 2×1500 μL | |
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DNA Ligase | 65 μL | 250 µL | |
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2X HiFi PCR Master Mix | 720 μL | 2×1600 μL | |
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/ |
Nuclease Free Water | 2.5 mL | 8 mL | |
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TE Solution | 1 mL | 4 mL | |
| Box2 |
/ |
NadPrep SP Beads | 4 mL | 15 mL |
双端唯一接头模块 (for MGI)
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003711 (24 rxn) |
包装体积 1003721 (96 rxn) |
包装体积 1003722 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
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NadPrep M-Adapter (DI) | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003751 (96 rxn) |
包装体积 1003752 (96 rxn) |
包装体积 1003753 (96 rxn) |
包装体积 1003754 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep M-Adapter (DI) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
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NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
通用截短型双端唯一接头模块
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003240 (24 rxn) |
包装体积 1003241 (96 rxn) |
包装体积 1003242 (96 rxn) |
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
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NadPrep Universal Stubby Adapter | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
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NadPrep Amplification Primer Mix II | 20 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003251 (96 rxn) |
包装体积
1003252 (96 rxn) |
包装体积
1003253 (96 rxn) |
包装体积
1003254 (96 rxn) |
|
|
NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep Universal Stubby Adapter | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
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NadPrep Amplification Primer Mix II | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 类别 | 产品 | 详情 | 货号 |
| 建库模块 | NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module, 24 rxn | 24 rxn | 1002411 |
| NadPrep® RNA & DNA Library Co-Preparation Module, 96 rxn | 96 rxn | 1002412 | |
|
双端唯一 接头模块 |
NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn |
MDI 1-12 24 rxn |
1003711 |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn |
MDI 1-24 96 rxn |
1003721 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn |
MDI 25-48 96 rxn |
1003722 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn |
MDI 1-96 96 rxn |
1003751 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn |
MDI 97-192 96 rxn |
1003752 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn |
MDI 193-288 96 rxn |
1003753 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn |
MDI 289-384 96 rxn |
1003754 | |
|
通用截短型 双端唯一 接头模块 |
NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn |
UDI 1-12 24 rxn |
1003240 |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn |
UDI 1-24 96 rxn |
1003241 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn |
UDI 25-48 96 rxn |
1003242 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn |
UDI 1-96 96 rxn |
1003251 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn |
UDI 97-192 96 rxn |
1003252 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn |
UDI 193-288 96 rxn |
1003253 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn |
UDI 289-384 96 rxn |
1003254 |
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400 8717 699 或 support@njnad.com。
