简便快捷
快速高效
灵活兼容
方案流程
方案表现
兼容多样本类型的不同投入量
兼容不同质量等级的FFPE样本
兼容第三方 RNA 建库试剂盒
图 4. NadPrep® rRNA 快速封阻全流程解决方案衔接第三方 RNA 文库构建试剂盒应用效果。A. rRNA 占比;B. 基因检出个数;C. 转录本覆盖;D. 表达谱相关性。250 ng 细胞系 K562 RNA 投入, 利用 NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Human) 分别搭配 NadPrep® 总 RNA 逆转录模块衔接 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒,KAPA 及 NEB RNA 文库构建试剂盒进行文库构建。50 ng 斑马鱼总 RNA 投入,利用 NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish) 分别搭配 NadPrep® 总 RNA 逆转录模块衔接 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒,Yeasen 及 ABclonal RNA 文库构建试剂盒进行文库构建。
注:H:Human;Z:Zebrafish。
兼容双测序平台
图 5. NadPrep® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 在双测序平台的性能表现。A. rRNA 占比;B. 基因检出个数。250 ng 投入,利用 NadPrep® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 衔接 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒分别搭配 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module 和 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行文库构建,DNBSEQ-T7, PE150 和 Illumina® Novaseq 6000, PE150 测序。
竞品比较
图 6. NadPrep® rRNA 快速封阻全流程解决方案 (Human) 与竞品性能比较。A. rRNA 占比;B. 基因检出个数;C. 转录本覆盖;D. 表达谱相关性。250 ng 投入,分别利用 NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Human)、Vendor A 和 Vendor B 搭配 NadPrep® 总 RNA 逆转录模块进行文库构建。
注:Vendor A:快速去除法;Vendor B:RNase H 酶法。C&D 仅以 Cell line (K562 RNA) 展示。
本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。
RNA-To-DNA 模块
/
/
包装编号
管盖颜色
组分名称
包装体积
1002401 (24 rxn)
包装体积
1002402 (96 rxn)
Box1
1st Strand Synth. Buffer
120 µL
460 µL
Random Primer
30 µL
115 µL
1st Strand Synth. Enzyme
60 µL
230 µL
2nd Strand Synth. Buffer
810 µL
2×1550 µL
2nd Strand Synth. Enzyme
90 µL
345 µL
Nuclease Free Water
2.5 mL
8 mL
Box2
NadPrep SP Beads
2.5 mL
10 mL
rRNA 快速封阻模块 · NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Human)
包装体积
包装体积
管盖颜色
组分名称
1002901 (24 rxn)
1002902 (96 rxn)
rRNA Blocking Reagent (Human)
30 µL
115 µL
rRNA 快速封阻模块 · NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish)
包装体积
包装体积
管盖颜色
组分名称
1002911 (24 rxn)
1002912 (96 rxn)
rRNA Blocking Reagent (Zebrafish)
30 µL
115 µL
转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类,其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中,链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性,测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链;而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息,测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比,链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量,明确基因结构,同时识别反义转录本以及发现更多新转录本,因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言,文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素;若需获取转录本方向性信息,应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案,均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。
类别 |
产品 |
详情 |
货号 |
rRNA 快速封阻模块 |
NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Human), 24 rxn |
24 rxn |
1002901 |
NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Human), 96 rxn |
96 rxn |
1002902 |
|
NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish), 24 rxn |
24 rxn |
1002911 |
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NadPrep® rRNA Blocking Reagent (Zebrafish), 96 rxn |
96 rxn |
1002912 |
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反转录模块 |
Nadprep® Total RNA-To-DNA Module, 24 rxn |
24 rxn |
1002401 |
Nadprep® Total RNA-To-DNA Module, 96 rxn |
96 rxn |
1002402 |
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