泛癌实体瘤靶向捕获自动化方案
应用背景
高通量测序技术的应用日益广泛，实验室对于大规模、高效率、高稳定的实验操作需求也越来越迫切。相比于人工操作，自动化工作站的方案在多个方面均有明显优势。纳昂达开发了自动加样系统 NadAuto-96，真正意义上实现“仪器+试剂+应用”的一站式自动化靶向捕获方案。
方案推荐
样品采用标准品 Human Genomic DNA Male；每个文库的投入量为 50 ng gDNA。
自动化流程使用仪器内置应用，每批次构建 96 个文库；捕获时每样本取 500 ng 捕获前文库进行单杂、4 杂、8 杂的实验，每批次分别为 24、12 和 12 个捕获反应。手动操作均按照产品说明书进行。
相关产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
图 1. 自动化与手动文库构建产出对比
图 2. 自动化构建的文库插入片段 注：96 个文库中随机选取 12 个文库，使用 Qseq 进行检测。
图 3. 自动化不同批次间文库构建产出差异
168 个自动化构建的 DNA 文库，分别进行每批次 24 个单杂捕获文库，24 个混杂捕获文库（12 个 4 杂和 12 个 8 杂）实验。
图 4. 自动化构建杂交捕获文库相对产出
自动化平台不同混杂方式构建的捕获文库的数据表现，如下：
图 5. 自动化平台不同混杂方式的捕获表现
图 6. 单杂插入片段大小和 GC 偏好性
图 7. 4 杂插入片段大小和 GC 偏好性
图 8. 8 杂插入片段大小和 GC 偏好性
