产品详情
μCaler® HotSpot Panel v1.0
#1101401
μCaler® HotSpot Panel v1.0 靶向肿瘤突变“热点”区域，涉及致癌和肿瘤抑制相关的 49 个热点突变基因，探针覆盖基因组约 25 Kb 区域。
该 Panel 与 μCaler® Hybrid Capture System 配套使用。基于全新的 μCaler® 靶向富集系统， μCaler® HotSpot Panel v1.0 提升了捕 获效率，捕获表现稳定优异且大幅度减少了实验所需时间，实现更高效的测序并节省成本。
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基因列表
| AKT1 | ALK | APC | AR | ARAF | ATM | BRAF | CDKN2A | CHEK2 | CTNNB1 |
| DDR2 | EGFR | ERBB2 | ERBB3 | ESR1 | FBXW7 | FGFR1 | FGFR2 | FGFR3 | FGFR4 |
| FLT3 | GNA11 | GNAQ | GNAS | HRAS | IDH1 | IDH2 | KIT | KRAS | MAP2K1 |
| MAP2K2 | MET | MTOR | NRAS | NTRK1 | NTRK3 | PDGFRA | PIK3CA | PTCH1 | PTEN |
| RAF1 | RET | ROS1 | SF3B1 | SMAD4 | SMO | STK11 | TP53 | TSC1 |
产品表现
捕获表现
图 1. μCaler® HotSpot Panel v1.0 的捕获表现。LDT OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience，LDT900) 利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行预文库构建； 500 ng/预文库投入，参照 μCaler® 杂交捕获指南。利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，On-target 按照 reads 数计算。A. 捕获数据的中靶率、比对率及靶区域覆盖度；B. 靶区域覆盖均一性。
注：LDT OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience， LDT900) 包含阴性质控品 (LDT Bioscience，LDT898) 和阳性质控品 (LDT Bioscience，LDT899) 。测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150。
变异分析
图 2. μCaler® HotSpot Panel v1.0 捕获数据中变异频率与标准品频率的一致性。利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 构建预文库，以 μCaler® HotSpot
Panel v1.0 完成杂交捕获，Vardict
1.5.1 进行变异分析。测序模式：Illumina
Novaseq 6000，PE150。
注：样本为 OncoOne 泛肿瘤 gDNA 标准品 (LDT Bioscience，LDT900) 。
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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货号 |
管盖 颜色 |
产品名称 |
包装 体积 |
包装/储存温度 |
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1101402 |
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μCaler® HotSpot Panel v1.0, 16 rxn |
40 μL |
-20℃ |
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1101401 |
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μCaler® HotSpot Panel v1.0, 96 rxn |
210 μL |
-20℃ |
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产品 |
货号 |
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μCaler® HotSpot Panel v1.0, 16 rxn |
1101402 |
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μCaler® HotSpot Panel v1.0, 96 rxn |
1101401 |
产品资料
应用指南
DEMO数据
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