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如何理解 UMI 分析中的 read-structure 即 3M4S+T(MGI 测序平台)?

浏览量:170 / 发布时间:2023-08-31
这是指读长的结构,其中 M 为分子标签读长;S  为忽略的碱基读长;T  为模板读长;“+”代表剩余碱基均为模板读长。双端应分别设置。对于每条 read 的前 7 个碱基:前三个是 UMI,后 4 个是固定碱基,第 8 个碱基即为插入序列第一个碱基,故 UMI 分析时需提取前 3 个碱基。