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NEXome Core Panel

货号：

#1001852（16 rxn）
#1001851（96 rxn）

NEXome Core Panel 在最新版本 Refseq（109，2021）和 CCDS 数据库的基础上，额外精心挑选了一些数据库之外值得关注的区域，同时基于产品延续性的考虑保留了部分最新版数据库中删去的区域。NEXome Core Panel 包含约 40 万条单独合成、单独质控的单链 DNA 探针，靶向 34.7Mb 基因组区域（19,613 基因）。 NEXome Core Panel 作为一款核心全外显子 Panel，可与不同的子 panel 组合搭配，满足不同的应用需求。

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生产质量与控制

单独合成单独质控

图 1. NEXome Core Panel 单条探针的质谱检测结果。理论分子量为 37542.9 Da，质谱检测结果显示，实测分子量为 37538.6 Da。

表 1. 每条探针分析的检测示例。

产品性能

捕获表现

图 2. NEXome Core Panel 对不同 gDNA 文库的捕获表现。
A. 捕获数据比对率和捕获效率； B. 靶区域覆盖度；C. 覆盖均一性和一致性；D. GC 偏好性。300 ng gDNA 利用 NadPrep^® 文库构建系列试剂盒建库，以 NEXome Core Panel (6 plex) 完成杂交捕获。利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，按照 reads 数计算。测序平台：Illumina Novaseq 6000，PE150；DNBSEQ-T7，PE150。
注：Male：人类男性基因组 DNA (Promega-Male, G1471)；Female：人类女性基因组 DNA (Promega-Female, G1521)。

变异一致性分析

图 3. NEXome Core Panel 捕获数据中变异频率与标准品频率的一致性。

利用 NadPrep^® 文库构建系列试剂盒建库，以 NEXome Core Panel 完成杂交捕获，Vardict 进行变异分析。测序平台：Illumina Novaseq 6000，PE150；DNBSEQ-T7，PE150。

注：样本为泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM800)，投入量 100 ng。

竞品比较

图 4. 不同外显子组 Panel 对不同 gDNA 文库的捕获效率和靶区域覆盖均一性的比较。

A. 捕获中靶率；B. 靶区域覆盖均一性；C. 靶区域覆盖深度。利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，按照 reads 数计算。测序平台：Illumina Novaseq 6000，PE150。

图 5. 相同测序数据量下不同全外显子组 Panel 在 80% 靶区域可达到的覆盖深度。

图 6. NEXome Core Panel 实际覆盖情况示例。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

货号

管盖

颜色

产品名称

包装

体积

包装/储存温度

1001852

NEXome Core Panel, 16 rxn

70 μL

–20℃

1001851

NEXome Core Panel, 96 rxn

415 μL

–20℃

NEXome 多杂表现如何？

完整标题：NEXome 多杂表现如何？ 以下是 12 杂 1 的实际表现（男性 gDNA 和女性 gDNA 各 6 个文库，500 ng/文库，取 25 M reads pair 数据分析）

NEXome 探针覆盖区域减小了，还可以覆盖外显子侧翼区域吗？

完整标题：NEXome 探针覆盖区域减小了，还可以覆盖外显子侧翼区域吗？

NEXome 只是减少了不必要的外显子侧翼覆盖，对于侧翼 20 bp 的覆盖是完全可以保证的。
如下图所示，测序数据共 10 G，insert size 236 bp 的数据中，99.7% 的外显子侧翼 20 bp 处达到 20x 覆盖，90% 外显子达到 53x，80% 达到 65x。

产品	货号
NEXome Core Panel, 96 rxn	1001851
NEXome Core Panel, 16 rxn	1001852

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

产品资料

应用指南

DEMO数据

NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_male_G1471_illumina_12Plex

完整标题：NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_male_G1471_illumina_12Plex 人类男性基因组DNA（Promega-male, G1471），超声打断，以Nanodigmbio NadPrep (for Illumina)系列建库试剂盒建库，NEXome Core Panel 靶向捕获的测试数据。

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NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_female_G1521_illumina_12Plex

完整标题：NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_female_G1521_illumina_12Plex 人类女性基因组DNA（Promega-female, G1521），超声打断，以Nanodigmbio NadPrep (for Illumina)系列建库试剂盒建库，NEXome Core Panel 靶向捕获的测试数据。

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NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_male_G1471_MGI

完整标题：NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_male_G1471_MGI 人类男性基因组DNA（Promega-male, G1471），超声打断，以Nanodigmbio NadPrep (for MGI)系列建库试剂盒建库，NEXome Core Panel 靶向捕获的测试数据。

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NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_male_G1471_illumina

完整标题：NEXome_Core_Panel_gDNA_Promega_male_G1471_illumina 人类男性基因组DNA（Promega-male, G1471），超声打断，以Nanodigmbio NadPrep (for Illumina)系列建库试剂盒建库，NEXome Core Panel 靶向捕获的测试数据。

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