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完整标题:使用μCaler® AML MRD酶切后产物浓度偏低的可能原因有哪些?该怎么解决?
可能原因 解决方案
片段化 DNA 投入量过低 酶切产物回收效率在 10% 左右,为保证有足够的酶切产物进行建库,可将足量的原始样本分多管同时进行酶切
完整标题:使用 μCaler® 杂交捕获后文库产出过高的可能原因有哪些?该怎么解决?

可能原因

解决方案

起始投入量过量

建议使用 Qubit™ 3.0 进行定量

扩增循环数偏高

根据操作指南推荐摸索最佳扩增循环数

洗脱过程未按照操作指南进行,导致脱靶严重

洗脱过程严格按照操作指南要求进行操作

完整标题:使用 μCaler® 杂交捕获后文库产出过低的可能原因有哪些?该怎么解决?

可能原因

解决方案

起始投入量不准确

实际起始投入量偏低,建议使用 qPCR 进行精确定量

转管时未将反应液全部转出

转管时务必将每一步的溶液全部转移至新的反应管

杂交以及磁珠纯化过程丢弃部分磁珠

洗脱过程操作避免过于剧烈,弃上清过程切勿丢失磁珠


完整标题:使用 μCaler® 杂交捕获后中靶率低的可能原因有哪些?该如何解决?

能原因

解决方案

洗脱过程产生大量气泡

移液器使用时需轻柔吹吸混匀,避免进入空气;若产生气泡,可先用移液器将液面上方气泡吸干净后再弃上清

未更换 PCR 管盖

严格按照说明书要求更换 PCR 管以及管盖

试剂未完全混匀

试剂使用前严格按照操作指南要求进行混匀,并置于相应的温度预热

完整标题:μCaler® MRD Solution 如何实现 3 天极速交付? 依赖于自有核酸合成工厂的全流程精准把控,自接收 MRD 订单的第一天启动高通量全自动合成 Probe,第二天依次完成修饰合成、氨解、洗脱定量、质控 (若不符合质控标准,则同步启动重合)、分装等;第三天依次完成重合分装、抽干、分装及 Panel 生产和产品包装发货等;确保 3 个工作日内交付。

完整标题:预文库低于 500 ng 是否可以进行杂交捕获? 可以。
完整标题:利用 NadPrep® 系列试剂盒构建的预文库或第三方试剂盒构建的预文库是否可按照 μCaler® MRD Solution (for Illumina ®) 使用说明书进行杂交捕获及后续操作? 建议使用纳昂达全套系列产品。
完整标题:μCaler® MRD Solution 生产是否依赖于进口,是否有断供的风险?  μCaler® MRD Solution 中核心组分均来源于国产,无需担心供货周期的问题。
完整标题:杂交时间是否可以再缩短? 30 min- 16 hr 杂交捕获性能基本一致,推荐选择 1 hr 为最佳平衡。
完整标题:如何提高 NGS 方案对于低频突变信号的检出率?

如何提高 NGS 方案对于低频突变信号的检出率?

① 增加样本投入量:样本起始量越多,支持低频突变检出的模板拷贝数越多;

② 增加跟踪突变数量:突变位点数量越高,检出概率越高。

31A
31B
注:a. 样本量越高,支持低频突变检出的模板拷贝数越高;b. 相同的样本量,突变位点数量越高,检出概率就会越高。
Abbosh C, Birkbak N J, Swanton C. Early stage NSCLC—challenges to implementing ctDNA-based screening and MRD detection[J]. Nature Reviews Clinical Oncology, 2018, 15(9): 577-586.
Van Der Pol Y, Mouliere F. Toward the early detection of cancer by decoding the epigenetic and environmental fingerprints of cell-free DNA[J]. Cancer cell, 2019, 36(4): 350-368.