DNA + RNA 双流程协同实现更全面精准的血液肿瘤检测

血液肿瘤具有高度异质性，不同分类在分子遗传特征上存在显著差异，涉及碱基替换、插入/缺失、拷贝数变异 (CNV) 和基因融合等多种类型变异。因此，全面精准的基因检测对于血液肿瘤的诊断、治疗策略制定及预后评估至关重要。

对血液肿瘤在 DNA 水平检测基因编码区及内含子，能够获取点突变、插入/缺失、CNV 及融合断点等信息，适用于全面筛查已知和潜在的致病变异；而 RNA 水平检测则直接聚焦于转录本层面的基因融合，不仅能明确识别真实发生的融合事件及其伴侣基因，还能评估融合转录产物的表达情况，揭示融合基因的功能性影响。

为了全方位解读血液肿瘤的基因突变谱，提升融合基因的检出能力，纳昂达现推出全新 DNA + RNA 双维度血液肿瘤基因检测组套 —— NanoHema Panel v2.0！

01 产品简介

NanoHema Panel v2.0 靶向 481个血液肿瘤相关基因，全面覆盖碱基替换、插入/缺失、基因扩增及基因融合等多种变异类型。

该 Panel 由 DNA 和 RNA 两部分组成：
DNA 部分覆盖 1.7 Mb 基因组区域，包含 436 个基因的全部编码区、12 个基因的部分内含子区及 IGH 基因 Switch 区；

RNA 部分覆盖 146 个基因，优化融合基因检测。

NanoHema Panel v2.0 通过多组学整合、高靶向性设计及临床实用性优化，为血液肿瘤的精准诊断、治疗决策及全程管理提供了高效、经济的分子检测方案。

图 1. NanoHema Panel v2.0 覆盖基因列表。

02 产品特色

多类型变异覆盖更全面
• 涵盖 481 个血液肿瘤相关基因，全面解析碱基替换、插入/缺失、扩增及基因融合等多种类型变异。

双流程协同结果更准确
• RNA 流程有效弥补 DNA 流程的局限，不仅精准识别融合基因伴侣，还能验证融合事件的功能性影响，保障检测结果的全面性和准确性。

个性化定制服务更灵活
• 支持 Panel 灵活拆分或增加目标基因，精准适配不同类型血液肿瘤的检测需求，满足科研探索和临床诊断的多元场景应用。

03 产品表现

3.1 NanoHema Panel v2.0_DNA

3.1.1 基础捕获性能稳定

使用 NanoHema Panel v2.0_DNA 对不同类型 gDNA 样本进行杂交捕获，并在多个平台进行测序。结果显示，捕获数据的关键性能指标均表现优异，其中比对率达到 99.9% 以上，平均中靶率达到 91% 以上 (图 2. A)，0.2x mean 和 0.5x mean 分别达到 99% 和 94% 以上 (图 2. B)，Fold 80 (图 2. C) 控制在 1.5 以下，平均测序深度接近 500x (图 2. D)。

图 2. NanoHema Panel v2.0_DNA 对不同类型 gDNA 样本的捕获表现。A. Mappability & On-target rate;比对率 & 中靶率；B. 靶区域覆盖度；C. Fold 80；D. 平均测序深度 (去重后)；E. GC 偏好性。50 ng 不同类型 gDNA 样本利用 NadPrep^® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep^® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 进行预文库构建，以 NanoHema Panel v2.0_DNA 搭配 NadPrep^® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获。测序模式分别为 Novaseq 6000，PE150 和 DNBSEQ-T7，PE150；随机选取 1.3 Gb 进行数据分析。

注：LDT-831 样本为血液肿瘤 gDNA 质控品 (LDT Bioscience，LDT-831A：AF = 5%；LDT-831D：AF = 0%)；Male 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)。

3.1.2 多类型变异检出

基于不同突变水平的 gDNA 质控品评估 NanoHema Panel v2.0_DNA 对突变的检出情况。结果显示，其检出的突变频率与质控品参考突变频率一致性较好。

表 1. NanoHema Panel v2.0_DNA 对标准品中检出的多类型变异分析。

3.2 NanoHema Panel v2.0_RNA

3.2.1 高效捕获中靶

通过对 K562 细胞系 RNA 构建预文库后杂交捕获，评估 NanoHema Panel v2.0_RNA 对靶区域的捕获情况，显示该 Panel 在不同测序平台的中靶率均能达到 96% 以上 (图 3.)。

图 3. NanoHema Panel v2.0_RNA 捕获测序数据组成。50 ng K562 细胞系 RNA 以 NadPrep^® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep^® DNA Library Preparation Kit v2 进行预文库构建，以 NanoHema Panel v2.0_RNA 搭配 NadPrep^® Hybrid Capture Reagents 完成杂交捕获。测序模式分别为 Novaseq 6000，PE150 (A) 和 DNBSEQT7，PE150 (B)。以 Salmon 进行分析。

3.2.2 精准检出融合

NanoHema Panel v2.0 新增单独 RNA 探针分管，不仅能够通过 RNA 精确识别融合基因的具体组合，还能验证融合是否导致异常转录本的产生，从而影响基因的表达模式。经测试，NanoHema Panel v2.0_RNA 在多个测序平台均能实现对融合组合的精准识别。

表 2. NanoHema Panel v2.0_RNA 对 K562 细胞系 RNA 中融合基因的检出。

通过 IGV 对 K562 细胞系 RNA 中的融合事件进行可视化展示。如图 4. 所示，BCR-ABL1 和 NUP214-XKR3 融合事件均被成功检出，进一步验证了结果的可靠性。

A

B

图 4. IGV 对 K562 细胞系 RNA 中融合事件的可视化展示。A. BCR-ABL1 融合事件；B. NUP214-XKR3 融合事件。

04 应用展望

NanoHema Panel v2.0 通过 DNA 和 RNA 双流程协同检测，可实现基因变异的多维度解析：DNA 检测提供广覆盖的变异筛查能力，RNA 检测精准确认融合表达及功能，共同保障检测的全面性和结果准确性。这种多组学整合策略不仅通过交叉验证显著提升结果的临床可信度，更能揭示传统单组学检测难以发现的隐匿性重排！