EN
产品服务

产品详情

NEXome XP Panel v1.0

NEXome XP Panel v1.0

货号：
#1001872
#1001871
NEXome XP Panel v1.0 是一款增强型扩展版全外显子捕获 Panel，在 NEXome Core Panel 的基础之上，扩展了对非编码区 ClinVar 位点、GENCODE 注释编码区以及免疫球蛋白和 T 细胞受体基因座的覆盖，同时包含了全基因组 SNP 骨架、实体瘤常见基因融合相关的内含子区域、经典微卫星位点等，覆盖人类基因组约 45.9 Mb 区域。
获取报价
  • 产品详情
  • 产品组分
  • 常见问题
  • 订购信息
  • 资料下载
  • 非编码区 ClinVar 位点
    • NEXome XP Panel v1.0 增强了对非编码区 ClinVar 位点的覆盖。
  • 编码区扩展
    • NEXome XP Panel v1.0 增强了对 GENCODE 注释编码区的覆盖，并针对参考基因组中包含和未包含的免疫球蛋白和 T 细胞受体基因座编码区进行了扩展。
  • 全基因组 SNP 骨架
    • 基于 1000 Genomes 数据库，侧重选择中国人群中高 MAF 值和高杂合率的位点 (> 9000 个) ，以约 300 Kb 的间隔覆盖整个人基因组，在全外显子组的基础上，提供更为丰富、分布更均匀的基因组组成状态信息，可用于 CNVs 和杂合性缺失检测。
  • 实体瘤相关融合区域

    • 包含常见融合相关的内含子区域和非编码区域，可用于分析实体瘤中的融合位点。

    ALK

    intron 18 - 19

    BCL2

    3'UTR

    BCR

    intron 8, 13 - 14

    BRAF

    intron 7 - 10

    BRCA1

    intron 2, 7 - 8, 12, 16, 19 - 20

    BRCA2

    intron 2

    CD74

    intron 6 - 8

    EGFR

    intron 7, 15, 24 - 27

    ETV4

    intron 5 - 6

    ETV5

    intron 6 - 7

    ETV6

    intron 5 - 6

    EWSR1

    intron 6 - 13

    EZR

    intron 9 - 12

    FGFR1

    intron 1, 5, 17

    FGFR2

    intron 1, 17

    FGFR3

    intron 17

    FLI1

    intron 3 - 8

    KIT

    intron 16

    KMT2A

    intron 6 - 11

    MET

    intron 1, 14

    MSH2

    intron 5

    MYB

    intron 14

    MYC

    intron 1

    NOTCH2

    intron 26

    NTRK1

    intron 8 - 10

    NTRK2

    intron 12, 15

    NTRK3

    intron 13 - 14

    NUTM1

    intron 1

    PDGFB

    intron 1

    PDGFRA

    intron 7, 9, 11

    RAF1

    intron 4 - 9

    RARA

    intron 2

    RET

    intron 7 - 11

    ROS1

    intron 31 - 35

    RSPO2

    Upstream, 5'UTR, exon 1 - 2, intron 1

    SDC4

    intron 2

    SLC34A2

    intron 4

    TMPRSS2

    intron 1 - 3






  • 经典微卫星位点
    • NEXome Core Panel 本身覆盖大量的微卫星位点，15 个优化设计的 MSI 经典位点的加入有助于不同微卫星不稳定分析方法间的比较以及分析流程的优化和校正。

    BAT-25

    BAT-26

    BAT-40

    BAT-RII

    NR-21

    NR-22

    NR-24

    NR-27

    MONO-27

    D2S123

    D5S346

    D17S261

    D17S520

    D17S250

    D18S34



捕获表现

1-16
图 1. NEXome XP Panel v1.0 对不同 gDNA 文库的捕获表现。不同 gDNA 经 NadPrep® DNA 通用型文库构建系列试剂盒分别搭配 NadPrep® Universal Stubby Adapter(UDI) Module 和 NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库，以 NEXome XP Panel v1.0 完成杂交捕获，利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，Ontarget 按照 reads 数计算。 A. 捕获数据比对率和捕获效率；B. 靶区域覆盖度；C. 覆盖均一性和一致性；D. GC 偏好性。
注：样本 gDNA_1-4 分别为：人类男性基因组 DNA (Promega-male, G1471)；人类女性基因组 DNA (Promega-female, G1521)；泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (菁良，GWOGTM800)；细胞系 gDNA 标准品 (Coriell，NA12878) 。测序模式分别为 Illumina Novaseq 6000，PE150 和 MGISEQ-2000，PE150。

变异一致性分析

2

图 2. NEXome XP Panel v1.0 捕获数据中变异频率与标准品频率的一致性。利用 NadPrep® DNA 通用型文库构建系列试剂盒建库，以 NEXome XP Panel v1.0完成杂交捕获，Vardict 进行变异分析。测序平台：Illumina Novaseq 6000，PE150；MGISEQ-2000，PE150。
注：样本为泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM800) 。

高置信变异检出率

3A
3B
图 3. NEXome XP Panel v1.0 对 NA12878 突变位点识别的灵敏度与阳性预测值。A.SNPs；B. Indels。

注：样本为细胞系 gDNA 标准品 (Coriell，NA12878) 。测序模式分别为 Illumina Novaseq 6000，PE150 和 MGISEQ-2000，PE150。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

货号

管盖

颜色

产品名称

包装

体积

包装/储存温度

1001871

NEXome XP Panel v1.0, 96 rxn

415 μL

–20℃

1001872

NEXome XP Panel v1.0, 16 rxn

70 μL

–20℃

NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？
完整标题：NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？

转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类，其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中，链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性，测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链；而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息，测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比，链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量，明确基因结构，同时识别反义转录本以及发现更多新转录本，因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言，文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素；若需获取转录本方向性信息，应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案，均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。

产品 货号
NEXome XP Panel v1.0, 16 rxn 1001872
NEXome XP Panel v1.0, 96 rxn 1001871
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

产品资料

应用指南

DEMO数据

NEXome_XP_Panel_v1_NA12878_MGI
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_NA12878_MGI 细胞系 gDNA（Coriell, NA12878），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for MGI) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
NEXome_XP_Panel_v1_GW-OGTM800_MGI
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_GW-OGTM800_MGI 泛肿瘤 800 gDNA（菁良, GW-OGTM800），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for MGI) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
NEXome_XP_Panel_v1_Promega_female_G1521_MGI
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_Promega_female_G1521_MGI 人类女性基因组 DNA（Promega, G1521），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for MGI) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
NEXome_XP_Panel_v1_Promega_male_G1471_MGI
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_Promega_male_G1471_MGI 人类男性基因组 DNA（Promega, G1471），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for MGI) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
NEXome_XP_Panel_v1_NA12878_Illumina
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_NA12878_Illumina 细胞系 gDNA（Coriell, NA12878），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
NEXome_XP_Panel_v1_GW-OGTM800_Illumina
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_GW-OGTM800_Illumina 泛肿瘤 800 gDNA（菁良, GW-OGTM800），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
NEXome_XP_Panel_v1_Promega_female_G1521_Illumina
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_Promega_female_G1521_Illumina 人类女性基因组 DNA（Promega, G1521），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
NEXome_XP_Panel_v1_Promega_male_G1471_Illumina
完整标题：NEXome_XP_Panel_v1_Promega_male_G1471_Illumina 人类男性基因组 DNA（Promega, G1471），超声打断，以 NadPrep® DNA 通用型文库构建试剂盒 (for Illumina®) 建库，NEXome XP Panel v1.0 靶向捕获的测试数据。
点击下载
COA查询

相关产品

解决方案
市场活动

DEMO 数据下载

如果您无法识别验证码，请点图片更换

我们的工作人员将在1个工作日内与您取得联系。

如果有任何问题，欢迎联系

400 8717 699 或 support@njnad.com。