产品详情

OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0

货号：

#1001511
#1001512

OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 靶向实体瘤研究中最为常见或有临床意义的融合相关的 105 个基因；探针叠瓦式覆盖其在 RefSeq 109 中正式收录的所有转录本编码区及部分涉及融合发生的 UTR 区。该 Panel 支持 RNA 水平的融合、变异和基因表达信息的富集。

获取报价

产品详情
产品组分
常见问题
订购信息
资料下载

基因列表及覆盖区域信息
ABL1*†	ABL2	AKT3	ALK	ARHGAP26	AXL	BCL2†	BCOR*	BRAF	BRD3*	BRD4*	CAMTA1
CCNB3*	CCND1	CIC†	COL6A3	CSF1R	DNAJB1	EGFR	EML4	EPC1*	ERBB2†	ERG*	ESR1
ETS1	ETV1*	ETV4	ETV5*	ETV6*	EWSR1	FGFR1	FGFR2	FGFR3	FGR*	FLI1	FLT3
FOSB	FOXO1	FUS	GLI1	HMGA2	INSR	JAK2*	JAK3	JAZF1	KIF5B†	KIT†	KMT2A
MAML2	MAST1	MAST2	MEAF6	MET*	MLLT3	MSH2	MSMB†	MUSK	MYB	MYC	NCOA1*
NCOA2*	NOTCH1	NOTCH2	NOTCH3†	NR4A3*	NRG1	NTRK1	NTRK2	NTRK3	NUMBL	NUTM1	PAX3
PAX7	PDGFB	PDGFRA	PDGFRB†	PHF1*	PIK3CA*	PKN1	PLAG1*	PPARG*	PRKACA	PRKCA	PRKCB
RAF1	RARA*	RELA	RET	ROS1	RSPO2*	RSPO3	SS18	STAT6*	TAF15	TCF12†	TCF3
TERT	TFE3	TFEB	TFG	THADA	TMPRSS2*†	TP53*	USP6*	YWHAE*

* 覆盖全部 5'-UTR；†覆盖全部 3'-UTR。

产品表现

捕获表现

图 1. OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 的捕获表现。A. 典型的捕获测序数据组成，B. 捕获测序与RNAseq数据靶基因相对丰度的比较。 Human Brain Total RNA 标准品 (HBR，Clontech，货号：636530) 利用 NadPrep^® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒系列建库，分别进行：直接测序 (RNAseq)，或 RNA 捕获测序 (OncoFu E)。

融合检测示例

图 2.OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 应用于 FFPE 融合 RNA 参考品的基因融合分析示例。A. OncoFu E 靶向富集与 RNAseq 的比较；B. 参考品倍数稀释后OncoFu E 的靶向富集表现。100 ng Seraseq^® FFPE Tumor Fusion RNA v4 Reference Material利用 NadPrep^® Total RNA-To-DNA Module 搭配 NadPrep^® DNA 通用型文库构建试剂盒系列建库，分别进行：直接测序 (RNAseq)，去除 rRNA 测序 (rRNA-depleted RNAseq，NEBNext rRNA Depletion Kit v2) 和 RNA 捕获测序 (OncoFu E)，并取 1 Gb 数据量进行融合分析 (FusionCatcher v1.10)。

本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。

货号	管盖颜色	产品名称	包装体积	包装/储存温度
1001512		OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 16 rxn	70 μL	-20℃
1001511		OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 96 rxn	415 μL	-20℃
1001513		OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 480 rxn	415 μL × 5	-20℃

OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 是否可用于捕获 DNA？

完整标题：OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0 是否可用于捕获 DNA？ 不可以，此 Panel 是基于转录本 cDNA 序列进行探针设计，不兼容 DNACap。

DNAcap 检测融合基因相较于 RNAcap 有哪些局限性？

完整标题：DNAcap 检测融合基因相较于 RNAcap 有哪些局限性？

1、Intron 区 repeats 无法放置探针；

2、Intron 区跨度巨大，需放置大量探针;

产品	货号
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 16 rxn	1001512
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 96 rxn	1001511
OncoFu Elite (for RNA) Panel v1.0, 480 rxn	1001513