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NanOnco Plus Panel v3.0

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#1001112F (16 rxn)
#1001111F (96 rxn)

NanOnco Plus Panel v3.0 靶向实体瘤研究中被广泛关注的 620 个基因 (含 HLA 基因) 的全部编码区、一系列与常见融合相关的内含子区域、经典的微卫星序列以及化疗相关多态位点，共涉及 637 个基因，覆盖基因组约 2.4 Mb 区域。支持包括碱基替换、插入/缺失、基因重排、基因扩增、微卫星不稳定在内的多种变异信息的富集。

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产品表现

捕获表现

图 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对不同 gDNA 文库的捕获表现。利用 NadPrep®快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep® UDI Adapter (for Illumina®) 构建文库，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150，利用 BWA 比对到参考基因组 hg38，按照 reads 数计算。A. 捕获数据比对率和捕获效率；B. 靶区域覆盖度；C. 覆盖均一性和一致性。
注：样本 gDNA_1-4 分别为：人类男性基因组 DNA (Promega-male, G1471)；肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM001)；肿瘤 SNV 1-25% gDNA 标准品(菁良，GW-OGTM004)；肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM005)。

多种变异分析

图2. NanOnco Plus Panel v3.0 捕获数据中变异频率与标准品标称频率的一致性展示。利用 NadPrep^® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep^® Universal Stubby Adapter (UDI) 构建文库，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150， Vardict 进行变异分析。

注：样本为 Onco Multiplex gDNA (LDTBIO，定制标准品)，平均测序深度 3518x。

表 1. NanOnco Plus Panel v3.0 对其他变异类型检测。

利用 NadPrep^® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒搭配 NadPrep^® UDI Adapter (for Illumina^®) 构建文库，测序模式为 Illumina Novaseq 6000，PE150， Vardict、Delly、CNVkit 分别进行变异分析。GW-OGTM001 的平均测序深度 966.71x，GW-OGTM005 的平均测序深度 1126.04x。
注：样本为肿瘤结构变异 5% gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM001) ，对照为肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (菁良，GW-OGTM005)。

仅限研究使用，不用于临床诊断。

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体积

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1001112F

NanOnco Plus Panel v3.0, 16 rxn

70 μL

–20℃

1001111F

NanOnco Plus Panel v3.0, 96 rxn

415 μL

–20℃

NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？

完整标题：NadPrep® 快速 RNA 文库构建试剂盒分为常规性文库和链特异性文库，两者有什么区别？

转录组测序 (RNA-Seq) 文库制备一般分为常规性和链特异性两类，其核心差异在于是否在测序文库中保留转录本的方向性信息。其中，链特异性文库在制备过程中保留了转录本的方向性，测序与下游分析时可判定转录本来源于 DNA 的正义链还是反义链；而常规性文库在 cDNA 合成过程中会丢失方向性信息，测序数据无法直接区分转录方向。与常规性 RNA-Seq 相比，链特异性 RNA-Seq 更能准确地统计转录本数量，明确基因结构，同时识别反义转录本以及发现更多新转录本，因此是研究基因结构与表达调控的重要手段。总体而言，文库制备方法的选择应基于实验目的、成本预算及参考转录组的可用性等因素；若需获取转录本方向性信息，应优先选择链特异性文库。无论选择何种方案，均应严格按照试剂盒使用说明书执行相应操作以确保数据质量。