捕获表现
图 1. HLAtyping Panel v2.0 的捕获表现。利用 HLAtyping Panel v2.0 分别对标准品进行靶向富集后,通过 Illumina® 平台进行测序。
注:标准品为 Class I 和 Class II UCLA DNA Reference Panel。HLAtyping Panel v2.0 的捕获表现由 24 种 Class I 和 24 种 Class II 计算平均值及标准偏差。
分型表现
表 1. HLAtyping Panel v2.0 对 Class I 的分型结果。
50 ng gDNA 利用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v2 建库,以 HLAtyping Panel v2.0 完成杂交捕获 (6 plex),Novaseq 6000 PE150 测序,数据量 ~ 0.5 Gb。测序结果以内部工具进行 HLA 分型。
注:标准品为 Class I UCLA DNA Reference Panel。每个标准品第一排为标准品提供的分型结果,第二排为 HLAtyping Panel v2.0 数据分型结果。
图 2. C1-213 以 HLAtyping Panel v2.0 捕获测序,测序数据比对回分型结果显示的型别的参考序列上,不允许错配的条件下对参考序列的覆盖情况。HLAtyping Panel v2.0 对 Class I 的分型结果中出现个别在第二数段上存在差异的结果,经过序列比对和检验发现,HLAtyping Panel v2.0 的新的分型结果更符合:在不允许错配比对的条件下,整条参考序列连续覆盖; 而旧的结果则出现覆盖的中断,即此处的序列组成缺乏支持。
注:C*08:02 (上) 为标准品 C1-213 提供的分型结果,覆盖不连续;C*08:01 (中) 为新的分型结果,覆盖连续;同时显示结果一致的另一个等位基因 C*12:02 的覆盖情况 (下)。
货号 |
管盖
颜色 |
产品名称 |
包装
体积 |
包装/储存温度 |
1001951 |
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HLAtyping Panel v2.0, 96 rxn |
415 μL |
–20℃ |
1001952 |
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HLAtyping Panel v2.0, 16 rxn |
70 μL |
–20℃ |
可能原因 | 解决方案 |
样本存在反应抑制剂 (如 EDTA、高 pH 值等) | 对样本进行纯化后再进行试验 |
试剂保存不当 | 试剂总量较大时,建议分装使用,避免反复冻融 |
本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。
产品名称(英文)
产品名称(中文)
货号
HLAtyping Panel v2.0, 16 rxn
白细胞抗原分型检测组套 v2.0,16 反应
1001952
HLAtyping Panel v2.0, 96 rxn
白细胞抗原分型检测组套 v2.0,96 反应
1001951
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