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NadPrep®️ 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3
#1002612
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建库流程
产品表现
文库产量稳定提升
图 1. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 及 v2 对不同起始投入量 gDNA 样本的建库产出。NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3 (NadPrep Enfrag v3) 和 v2 (NadPrep Enfrag v2) 分别搭配 A. NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module 和 B. NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module (for MGI) 构建文库，酶切 20 min，扩增循环数参考相应说明书。
注：样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)。
多类型样本灵活兼容
图 2. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 及 v2 对不同类型样本的建库产出。
注：gDNA 样本为人类基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471)；样本分级标准 | gDNA：~ 15 Kb 有明亮单一不拖尾条带；FFPE B：~ 15 Kb 有隐约可见主带，同时存在中度弥散；FFPE C：条带主要分布在 200-2500 bp，呈弥散状；FFPE D：条带主要分布在 250-1000 bp，呈弥散状。
保持低水平背景噪音
文库丰富度显著提升
图 4. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 较 v2 显著提升文库丰富度。分别使用 NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3、v2、Vendor A* 和 Vendor B* 构建预文库，500 ng/预文库投入杂交，以 μCaler® Full Screen LF Custom Panel (针对 GW-OGTM800 标准品所包含的 15 个突变设计的定制探针) 和 μCaler® Hybrid Capture Reagents v2 完成捕获。每个样本随机选取 2 M reads pair 去重后用于数据分析，以双链一致性序列 (Duplex Consensus Sequences， DCS211) 、单链一致性序列 (SSCS) 为标准进行过滤。
注：样本为泛肿瘤 800 gDNA 标准品 (GeneWell，GW-OGTM800)，起始投入量为 50 ng。
野生型 SNV gDNA 样本突变评估
图 5. 对肿瘤野生型 SNV gDNA 样本经不同酶切文库构建试剂盒构建文库的捕获数据中的突变统计。以 NanOnco Plus Panel v3.0 和 NadPrep® Hybrid Capture Reagents 完成捕获。每个样本随机选取 10 M reads pair 去重后用于数据分析，对背景噪音频率为 0-0.005 的每个位点的突变进行统计 (过滤标准为reads ≥ 3)。
注：样本为肿瘤 SNV 野生型 gDNA 标准品 (GeneWell，GW-OGTM005)，起始投入量为 50 ng。
靶向捕获性能优异稳定
图 6. NadPrep® 快速 DNA 酶切文库构建试剂盒 v3 构建文库的捕获表现。每个样本随机选取 2 M reads pair 用于数据分析，按照 total reads 计算。A. 比对率 & 中靶率；B. 靶区域覆盖度；C. Fold 80；D. 嵌合体比例 (嵌合体 reads 数/reads 总数)。
文库构建模块
| 包装编号 | 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1002601(24 rxn) |
包装体积 1002602 (96 rxn) |
| Box1 |
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FERA Buffer III | 300 µL | 1200 µL |
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FERA Enzyme III | 150 µL | 575 µL | |
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Enhancer Buffer | 250 µL | 950 µL | |
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Ligation Buffer III | 750 µL | 2×1500 µL | |
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DNA Ligase III | 65 µL | 250 µL | |
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2X HiFi PCR Master Pro Mix | 720 µL | 2×1600 µL | |
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/ |
Nuclease Free Water | 2.5 mL | 8 mL | |
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TE Solution | 1 mL | 4 mL | |
| Box2 |
/ |
NadPrep SP Beads | 4 mL | 15 mL |
单端接头模块 (for MGI)
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003611 (24 rxn) |
包装体积 1003621 (96 rxn) |
包装体积 1003622(96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (SI) Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
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NadPrep M-Adapter (SI) | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003641 (96 rxn) |
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NadPrep M-Index (SI) Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep M-Adapter (SI) | 260 µL (Tube) |
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NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, SI) | 75 µL (Tube) |
双端唯一接头模块 (for MGI)
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003711 (24 rxn) |
包装体积 1003721 (96 rxn) |
包装体积 1003722 (96 rxn) |
包装体积 1003725 (96 rxn) |
包装体积 1003726 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Adapter (DI) | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003751 (96 rxn) |
包装体积 1003752 (96 rxn) |
包装体积 1003753 (96 rxn) |
包装体积 1003754 (96 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
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NadPrep M-Adapter (DI) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
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|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003761 (1152 rxn) |
包装体积 1003762 (1152 rxn) |
包装体积 1003763 (1152 rxn) |
包装体积 1003764 (1152 rxn) |
|
|
NadPrep M-Index (MDI) Primer Mix # | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Adapter (DI) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) |
|
|
NadPrep M-Amplification Primer Mix (for MGI, DI) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) |
通用截短型双端唯一接头模块
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003240 (24 rxn) |
包装体积 1003241 (96 rxn) |
包装体积 1003242 (96 rxn) |
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 12×15 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) | 24×25 µL (Tube) |
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NadPrep Universal Stubby Adapter | 60 µL (Tube) | 230 µL (Tube) | 230 µL (Tube) |
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NadPrep Amplification Primer Mix II | 20 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
包装体积 |
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NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) | 96×8 µL (Plate) |
|
|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) | 260 µL (Tube) |
|
|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) | 75 µL (Tube) |
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003261 (1152 rxn) |
包装体积 1003262 (1152 rxn) |
包装体积 1003263 (1152 rxn) |
包装体积 1003264 (1152 rxn) |
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|
NadPrep Universal UDI-index Primer Mix # | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) | 96×72 µL (Tube) |
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|
NadPrep Universal Stubby Adapter | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) | 2×1350 µL (Tube) |
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|
NadPrep Amplification Primer Mix II | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) | 900 µL (Tube) |
全长型双端唯一接头模块（for Illumina）
| 管盖颜色 | 组分名称 |
包装体积 1003211 (24 rxn) |
包装体积 1003222 (24 rxn) |
包装体积 1003211 (96 rxn) |
包装体积 1003212 (96 rxn) |
包装体积 1003213 (192 rxn) |
包装体积 1003224* (480 rxn) |
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NadPrep UDI Adapter # | 12×10 µL (Tube) | 12×10 µL (Tube) | 12×22 µL (Tube) | 12×22 µL (Tube) | 24×22 µL (Tube) | 96×3.5 µL (Plate)×5 |
| 类别 | 产品 | 详情 | 货号 |
| 建库模块 | NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3, 24 rxn | 24 rxn | 1002611 |
| NadPrep® EZ DNA Library Preparation Module v3, 96 rxn | 96 rxn | 1002612 | |
| 截短型单端接头模块 | NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | 24 rxn | 1003611 |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | 96 rxn | 1003621 | |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | 96 rxn | 1003622 | |
| NadPrep® Universal Adapter (SI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | 96 rxn | 1003641 | |
| 截短型双端唯一接头模块 | NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set A1 (for MGI), 24 rxn | MDI 1-12 | 1003711 |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-24 | 1003721 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B2 (for MGI), 96 rxn | MDI 25-48 | 1003722 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B3 (for MGI), 96 rxn | MDI 49-72 | 1003725 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set B4 (for MGI), 96 rxn | MDI 73-96 | 1003726 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E1 (for MGI), 96 rxn | MDI 1-96 | 1003751 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E2 (for MGI), 96 rxn | MDI 97-192 | 1003752 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E3 (for MGI), 96 rxn | MDI 193-288 | 1003753 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set E4 (for MGI), 96 rxn | MDI 289-384 | 1003754 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F1 (for MGI), 1152 rxn | MDI 1-96 | 1003761 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F2 (for MGI), 1152 rxn | MDI 97-192 | 1003762 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F3 (for MGI), 1152 rxn | MDI 193-288 | 1003763 | |
| NadPrep® Universal Adapter (MDI) Module Set F4 (for MGI), 1152 rxn | MDI 289-384 | 1003764 | |
| 通用截短型双端唯一接头模块 | NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set A1, 24 rxn | Index 1-12 | 1003240 |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B1, 96 rxn | Index 1-24 | 1003241 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set B2, 96 rxn | Index 25-48 | 1003242 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E1, 96 rxn | Index 1-96 | 1003251 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E2, 96 rxn | Index 97-192 | 1003252 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E3, 96 rxn | Index 193-288 | 1003253 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E4, 96 rxn | Index 289-384 | 1003254 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E5, 96 rxn | Index 385-480 | 1003255 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E6, 96 rxn | Index 481-576 | 1003256 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E7, 96 rxn | Index 577-672 | 1003257 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set E8, 96 rxn | Index 673-768 | 1003258 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F1, 1152 rxn | Index 1-96 | 1003261 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F2, 1152 rxn | Index 97-192 | 1003262 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F3, 1152 rxn | Index 193-288 | 1003263 | |
| NadPrep® Universal Stubby Adapter (UDI) Module Set F4, 1152 rxn | Index 289-384 | 1003264 | |
| 全长型双端唯一接头模块 | NadPrep® UDI Adapter Kit Set A (for Illumina®), 96 rxn |
Index 1-12 300 pmol / 接头 |
1003211 |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set B (for Illumina®), 96 rxn |
Index 13-24 300 pmol / 接头 |
1003212 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set A&B (for Illumina®), 192 rxn |
Index 1-24 300 pmol / 接头 |
1003213 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set C1 (for Illumina®), 24 rxn |
Index 1-12 24 rxn |
1003221 | |
| NadPrep® UDI Adapter Kit Set D1 (for Illumina®), 480 rxn |
Index 1-96 480 rxn |
1003224 |
本产品仅限研究使用，不用于临床诊断。
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